正保會(huì)計(jì)網(wǎng)校編輯注：根據(jù)國家稅務(wù)總局公告[2011]第2號文件規(guī)定，本文廢止。　

各省、自治區(qū)、直轄市和計(jì)劃單列市國家稅務(wù)局、地方稅務(wù)局：

　　《國家稅務(wù)總局關(guān)于國家經(jīng)貿(mào)委管理的10個(gè)國家局所屬科研機(jī)構(gòu)轉(zhuǎn)制后稅收征收管理問題的通知》（國稅發(fā)[1999]135號）、《國家稅務(wù)總局關(guān)于貫徹落實(shí)<中共中央國務(wù)院關(guān)于加強(qiáng)技術(shù)創(chuàng)新，發(fā)展高科技，實(shí)現(xiàn)產(chǎn)業(yè)化的決定>有關(guān)所得稅問題的通知》（國稅發(fā)[2000]24號），以及我局和科技部等六部門《關(guān)于印發(fā)建設(shè)部等11個(gè)部門（單位）所屬134個(gè)科研機(jī)構(gòu)轉(zhuǎn)制方案的通知》（國科發(fā)政字[2000]300號）下發(fā)后，各地在執(zhí)行過程中提出了一些問題。為了更好地貫徹落實(shí)中共中央、國務(wù)院有關(guān)文件精神，加強(qiáng)企業(yè)所得稅征收管理，經(jīng)研究，現(xiàn)就有關(guān)問題補(bǔ)充通知如下：

　　一、國科發(fā)政字[2000]300號文件所列134家轉(zhuǎn)制科研機(jī)構(gòu)，從2001年起至2005年內(nèi)免征企業(yè)所得稅。(標(biāo)為灰色部分已于2006年4月30日失效)

　　二、科研機(jī)構(gòu)聯(lián)合其他企業(yè)組建有限責(zé)任公司或股份有限公司，科研機(jī)構(gòu)在轉(zhuǎn)制企業(yè)中的股權(quán)比例達(dá)到50%的，按政策規(guī)定期限免征企業(yè)所得稅。

　　三、科研機(jī)構(gòu)與工程勘察設(shè)計(jì)單位聯(lián)合其他企業(yè)組建有限責(zé)任公司或股份有限公司，其中科研機(jī)構(gòu)在轉(zhuǎn)制企業(yè)中的股權(quán)比例達(dá)到50%的，按本通知第二條規(guī)定免征所得稅；工程勘察設(shè)計(jì)單位在轉(zhuǎn)制企業(yè)中的股權(quán)比例達(dá)到50%或者科研機(jī)構(gòu)與工程勘察設(shè)計(jì)單位在新組建企業(yè)中股權(quán)均達(dá)不到50%，但兩者股權(quán)合計(jì)達(dá)到50%的，按工程勘察設(shè)計(jì)單位轉(zhuǎn)制政策減半征收所得稅。

　　四、科研機(jī)構(gòu)在轉(zhuǎn)制企業(yè)中無形資產(chǎn)的價(jià)值所占股份比例低于20%的，其超過部分不作為計(jì)算減免稅的股權(quán)。

　　五、鑒于轉(zhuǎn)制科研機(jī)構(gòu)優(yōu)惠政策的起訖時(shí)間不同，國稅發(fā)[1999]135號附件所列242家科研機(jī)構(gòu)以及其他科研機(jī)構(gòu)及工程勘察設(shè)計(jì)單位在轉(zhuǎn)制企業(yè)中的股權(quán)比例，并按本通知第三條規(guī)定的精神確定是否享受減免所得稅政策。

　　六、根據(jù)《國家稅務(wù)總局關(guān)于印關(guān)<企業(yè)所得稅減免管理辦法>的通知》（國稅發(fā)[1997]99號）規(guī)定，轉(zhuǎn)制企業(yè)減免稅實(shí)行一次審批的辦法，但在減免稅期間，主管稅務(wù)機(jī)關(guān)要對轉(zhuǎn)制企業(yè)享受優(yōu)惠政策的股權(quán)比例進(jìn)行年檢核實(shí)，達(dá)不到規(guī)定比例的，應(yīng)取消其減免稅資格。