《增值稅暫行條例》第六條及《增值稅暫行條例實施細則》第十二條規(guī)定，增值稅的應稅銷售額為納稅人銷售貨物或應稅勞務向購買方收取的全部價款和價外費用。其中，價外費用包括在價外向購買方收取的代墊款項、運輸裝卸費等，但不包括同時符合承運部門的運輸費用發(fā)票開具給購買方、納稅人將該項發(fā)票轉交給購買方這兩個條件的代墊運輸費用。
但是，由于購銷雙方對稅務處理的認識并不統(tǒng)一，因此企業(yè)在日常生產經營活動中，經常會遇到用預收賬款支付運費的情況。那么，用預收賬款支付運費是否應繳納增值稅呢?
●如果承運主體是銷售方非單獨核算的運輸車輛，則屬于《增值稅暫行條例實施細則》第五條規(guī)定的混合銷售行為，從事貨物的生產、批發(fā)或者零售的企業(yè)、企業(yè)性單位以及個體工商戶，應該就收取的運費（含稅金額等于支付運費金額，下同）并入銷售額繳納增值稅。其他單位和個人收取的運費，視為銷售非增值稅應稅勞務，不繳納增值稅。
例：某原煤生產企業(yè)2011年1月份銷售原煤2000噸，每噸售價500元（不含稅價），收取價款1000000元，用本企業(yè)未單獨核算的運輸車輛運送，每噸收取運費25元（含稅），共收取運輸費用50000元，發(fā)生增值稅進項稅額75000元，貨款和運費收入均來自于購買方提前預付賬款。該企業(yè)應繳納的增值稅為[1000000+50000÷(1+17%)]×17%-75000=102264.96（元）。
●如果承運主體是銷售方獨立核算的運輸車輛，則收取的運費屬于兼營非增值稅應稅勞務。根據《增值稅暫行條例實施細則》第七條規(guī)定：“納稅人兼營非增值稅應稅項目的，應分別核算貨物或者應稅勞務的銷售額和非增值稅應稅項目的營業(yè)額;未分別核算的，由主管稅務機關核定貨物或者應稅勞務的銷售額。”因此，在這種情況下，納稅人收取的運費應該繳納營業(yè)稅。
例：某鐵精粉生產企業(yè)2011年5月份銷售含鐵量52%的鐵精粉700噸，每噸售價500元（不含稅價），收取價款350000元，用本企業(yè)獨立核算的運輸車輛運送，每噸收取運費30元，共收取運輸費用21000元，發(fā)生增值稅進項稅額21000元，貨款和運費收入均來自于購買方提前預付賬款，則該企業(yè)應繳納的增值稅為350000×17%-21000=38500（元）。
假如該企業(yè)在銷售鐵精粉的過程中，未分別核算銷售鐵精粉和收取運輸費用金額，則應由國稅、地稅兩個主管稅務機關分別依據《增值稅暫行條例實施細則》第七條和《營業(yè)稅暫行條例實施細則》第八條規(guī)定，核定銷售鐵精粉和收取運輸費用金額，銷售鐵精粉金額繳納增值稅，收取運輸費用金額繳納營業(yè)稅。