段永基、吳敬璉、劉永好等全國政協(xié)委員共同提交了一份建議調(diào)整中小企業(yè)增值稅的提案。段永基指出，真正發(fā)揮創(chuàng)新價值的企業(yè)中，70%以上都是中小企業(yè)，而對中小企業(yè)最實在的支持就是稅收支持。
根據(jù)國務院關于技術創(chuàng)新的扶持政策，企業(yè)研發(fā)投入可按150%的比例從企業(yè)所得稅中抵扣。但我國絕大多數(shù)中小型科技企業(yè)長期處于投入小、資金缺、風險大、利潤薄的窘困狀況。段永基認為，從企業(yè)所得稅中抵扣研發(fā)費，對這類企業(yè)幫助不大，完全起不到鼓勵自主創(chuàng)新、增強創(chuàng)新能力的作用，而如果能夠改為從企業(yè)增值稅中抵扣，企業(yè)則可得到較大實惠。
我國現(xiàn)行規(guī)定，企業(yè)消耗的生產(chǎn)資料可作為進項稅進行抵扣，但生產(chǎn)設備和勞動工具作為固定資產(chǎn)核算的部分不能抵扣；同時，企業(yè)研發(fā)費用、技術轉(zhuǎn)讓費用，特別是研發(fā)人員人力成本及科技咨詢費用的投入也不能抵扣進項稅額。委員們認為，這種稅收政策十分有利于加工貿(mào)易企業(yè)、高能耗和高資源消耗企業(yè)，但十分不利于技術創(chuàng)新型企業(yè)。為此，他們建議中小型科技企業(yè)的研發(fā)成本，一律作為進項成本抵扣。
