一、申報明細表與年度財務(wù)報表既關(guān)聯(lián)又有區(qū)別

　　申報明細表與年度財務(wù)報表相關(guān)聯(lián)，是指企業(yè)最近三個會計年度研究開發(fā)費用結(jié)構(gòu)明細表和最近一年高新技術(shù)產(chǎn)品（服務(wù)）收入明細表的相關(guān)數(shù)據(jù)包含在已審計的年度財務(wù)報表中，兩者適用的會計準則或會計制度是一致的，在相關(guān)會計政策、會計估計方面不存在差異。

　　但申報明細表又區(qū)別于年度財務(wù)報表。企業(yè)最近三個會計年度研究開發(fā)費用結(jié)構(gòu)明細表和最近一年高新技術(shù)產(chǎn)品（服務(wù)）收入明細表是按照《高新技術(shù)企業(yè)認定管理辦法》和《高新技術(shù)企業(yè)認定管理工作指引》編制的，其列報的數(shù)據(jù)可以直接反映出企業(yè)是否滿足認定條件。

　　二、專項審計的實施

　　不論企業(yè)以前年度財務(wù)報表是否委托注冊會計師進行審計，還是專項審計與年度財務(wù)報表審計是否為同一家會計師事務(wù)所承接，專項審計都可以按照《專項審計指引》獨立實施審計程序。如果結(jié)合以前年度財務(wù)報表審計，確定的重要性水平應(yīng)當?shù)陀谙鄳?yīng)財務(wù)報表審計的重要性水平，確定審計范圍時應(yīng)當考慮擬利用以前年度財務(wù)報表審計工作中獲取的審計證據(jù)的程度。需要注意的是，應(yīng)當結(jié)合具體環(huán)境考慮重要性的性質(zhì)和數(shù)量兩方面的因素。

　　三、專項審計對高新技術(shù)產(chǎn)品或服務(wù)識別的要求

　　無論是研究開發(fā)費用，還是高新技術(shù)產(chǎn)品（服務(wù)），在專項審計中都涉及高新技術(shù)的識別。注冊會計師不是高新技術(shù)領(lǐng)域的專家，《專項審計指引》為此做了如下規(guī)定：（1）恰當界定研究開發(fā)項目、高新技術(shù)產(chǎn)品（服務(wù)）的具體范圍是申報企業(yè)的責任。（2）申報企業(yè)技術(shù)負責人與企業(yè)法定代表人、財務(wù)負責人共同簽署《管理當局聲明書》。

　　但《專項審計指引》也規(guī)定，制定總體審計策略時，應(yīng)當清楚地說明向具體審計領(lǐng)域調(diào)配的資源，包括就復雜的研究開發(fā)項目技術(shù)問題利用專家的工作。

　　四、風險導向?qū)徲嬂砟钤趯ｍ棇徲嬛械膽?yīng)用

　　《專項審計指引》要求針對研究開發(fā)項目和高新技術(shù)產(chǎn)品（服務(wù)）了解申報企業(yè)及其環(huán)境，比如，了解申報企業(yè)產(chǎn)品（服務(wù)）的技術(shù)變化，了解申報企業(yè)研究開發(fā)部門的設(shè)置和分布，以及是否存在專門的機構(gòu)和人員從事研究開發(fā)活動，了解申報企業(yè)為從事研究開發(fā)活動而進行的固定資產(chǎn)投入以及為這些投入而使用的資金的來源，了解申報企業(yè)是否確立了創(chuàng)建科技創(chuàng)新型企業(yè)的發(fā)展戰(zhàn)略，了解申報企業(yè)是否將高新技術(shù)產(chǎn)品（服務(wù)）收入作為主要的業(yè)績考核指標。

　　《專項審計指引》要求識別和評估申報明細表層次以及各類交易、列報認定層次的重大錯報風險。申報明細表層次重大錯報風險需要從整體上加以判斷，比如，申報企業(yè)不能提供研究開發(fā)項目的相關(guān)計劃與實施方案、研究開發(fā)記錄，申報明細表整體上就可能存在重大錯報風險。申報明細表層次重大錯報風險很可能源于薄弱的控制環(huán)境，特別是凌駕于內(nèi)部控制制度之上時，很可能偽造或篡改編制申報明細表所依據(jù)的會計記錄或相關(guān)文件。

　　《專項審計指引》要求注冊會計師應(yīng)當假定申報企業(yè)的高新技術(shù)研究開發(fā)費用支出與高新技術(shù)產(chǎn)品（服務(wù)）收入存在舞弊風險；應(yīng)當考慮申報企業(yè)管理層有可能存在為了申請高新技術(shù)企業(yè)資格以享受稅收優(yōu)惠政策的動機，導致高新技術(shù)研究開發(fā)費用支出與高新技術(shù)產(chǎn)品（服務(wù)）收入存在重大錯報風險。

　　五、對與申報明細表相關(guān)的內(nèi)部控制制度的了解

　　《專項審計指引》勾畫了與申報明細表相關(guān)的內(nèi)部控制制度，強調(diào)了解這些內(nèi)部控制是識別、評估重大錯報風險以及設(shè)計和實施進一步審計程序的基礎(chǔ)。

　　與高新技術(shù)產(chǎn)品（服務(wù)）收入相關(guān)的內(nèi)部控制包含在企業(yè)產(chǎn)品或服務(wù)的銷售控制中，而如高新技術(shù)產(chǎn)品（服務(wù)）收入與研究開發(fā)激勵或與銷售獎勵相關(guān)聯(lián)時，企業(yè)一般會設(shè)計或增加相應(yīng)的控制環(huán)節(jié)。注冊會計師審計時，需要了解申報企業(yè)能否確保銷售均已準確記錄并對高新技術(shù)產(chǎn)品（服務(wù)）進行恰當分類。

　　在財務(wù)報表審計中，一般不專門提及與高新技術(shù)研究開發(fā)費用支出相關(guān)的內(nèi)部控制?！秾ｍ棇徲嬛敢窂娬{(diào)研究開發(fā)費用控制通常屬于申報企業(yè)費用和成本控制的重要組成部分，要求注冊會計師在對研究開發(fā)費用控制進行了解時，需要考慮那些影響研究開發(fā)費用完整性、發(fā)生、準確性和分類的控制點。同時，《專項審計指引》給出了研究開發(fā)業(yè)務(wù)流程通常可能包括的主要活動，如立項和預算管理、人員管理、材料和設(shè)備管理以及結(jié)項管理等。

　　六、專項審計報告的審計

　　基于申請高新技術(shù)企業(yè)認定的目的，申報企業(yè)通常將最近三個會計年度研究開發(fā)費用結(jié)構(gòu)明細表和最近一年高新技術(shù)產(chǎn)品（服務(wù)）收入明細表的專項審計同時委托給一家會計師事務(wù)所，《專項審計指引》要求，針對研究開發(fā)費用結(jié)構(gòu)明細表和高新技術(shù)產(chǎn)品（服務(wù)）收入明細表分別出具專項審計報告。

　　由于研究開發(fā)費用結(jié)構(gòu)明細表涉及三個會計年度，注冊會計師出具非標準專項審計報告時需要指明導致事項所對應(yīng)的會計年度。