新《企業(yè)所得稅法實施條例》第十條規(guī)定：企業(yè)所得稅法第五條所稱虧損，是指企業(yè)依照企業(yè)所得稅法和本條例的規(guī)定將每一納稅年度的收入總額減除不征稅收入、免稅收入和各項扣除后小于零的數額�！�中華人民共和國企業(yè)所得稅法》（中華人民共和國主席令第63號）第十八條規(guī)定：“企業(yè)納稅年度發(fā)生的虧損，準予向以后年度結轉，用以后年度的所得彌補，但結轉年限最長不得超過五年。”
根據國稅發(fā)[1997]189號文件規(guī)定，“稅法所指虧損的概念，不是企業(yè)財務報表中所反映的虧損額，而是企業(yè)財務報表中的虧損額經主管稅務機關按稅法規(guī)定調整后的金額。”這里的“五年”，是指稅收上計算彌補虧損的期限，只對計算應納稅所得額產生影響，而在彌補虧損的會計核算中，并不受“五年”期限的限制。會計上，無論是盈利還是虧損，期末一律將“本年利潤”科目的余額，結轉“利潤分配-未分配利潤”科目。這里的“本年利潤”余額是指扣除所得稅費用后的凈利潤。
企業(yè)彌補虧損的方式：1．企業(yè)發(fā)生虧損，可以用次年度的稅前利潤彌補，次年度利潤不足彌補的，可以在5年內延續(xù)彌補。2．企業(yè)發(fā)生的虧損，5年內的稅前利潤不足彌補時，用稅后利潤彌補。這種方式不確認遞延所得稅。稅法上在計算應稅所得時不能扣除虧損余額。3．企業(yè)發(fā)生的虧損，可以用盈余公積彌補。借記“盈余公積” 科目，貸記“利潤分配——盈余公積補虧” 科目。
幾種特殊情況下虧損的彌補方法
1.分立（兼并、股權重組）虧損彌補
國家稅務總局《關于印發(fā)〈企業(yè)所得稅稅前彌補虧損審核管理辦法〉的通知》（國稅發(fā)[1997]189號）規(guī)定，1.企業(yè)分立前尚未彌補的經營虧損，根據分立協(xié)議約定由分立后的各企業(yè)負擔的數額，按稅收法規(guī)規(guī)定的彌補年限，在剩余期限內，由分立后的各企業(yè)逐年延續(xù)彌補。2.被兼并企業(yè)尚未彌補的經營虧損，區(qū)別不同情況處理：①被兼并企業(yè)在被兼并后繼續(xù)具有獨立納稅人資格的，其兼并前尚未彌補的經營虧損，在稅法規(guī)定的期限內，由其以后年度的所得逐年延續(xù)彌補，不得用兼并企業(yè)的所得彌補；②被兼并企業(yè)在被兼并后不具有獨立納稅人資格的，其兼并前尚未彌補的經營虧損，在稅法規(guī)定的期限內，可由兼并企業(yè)用以后年度的所得逐年延續(xù)彌補。3.企業(yè)進行股權重組，在股權轉讓前尚未彌補的經營虧損，可按稅法規(guī)定的彌補年限，在剩余期限內，由股權重組后的企業(yè)逐年延續(xù)彌補。
2.免稅所得彌補虧損
國家稅務總局《關于企業(yè)的免稅所得彌補虧損問題的通知》（國稅發(fā)[1999]34號）規(guī)定，如果一個企業(yè)既有應稅項目，又有免稅項目，其應稅項目發(fā)生虧損時，按照稅收法規(guī)規(guī)定可以結轉以后年度彌補的虧損，應該是沖抵免稅項目所得后的余額。此外，雖然應稅項目有所得，但不足彌補以前年度虧損的，免稅項目的所得也應用于彌補以前年度虧損。
3.匯總納稅企業(yè)的彌補虧損
國家稅務總局《關于進一步加強匯總納稅企業(yè)所得稅管理的通知》（國稅發(fā)[2000]185號）明確規(guī)定，匯總納稅企業(yè)匯總后為虧損的，其虧損額由總機構用以后年度的匯總所得按規(guī)定彌補，匯總納稅企業(yè)取消匯總納稅后，其以前年度匯總尚未彌補的虧損額，經主管稅務機關審核確認后，報經國家稅務總局批準，可按照各虧損成員企業(yè)以前年度發(fā)生虧損額的比例進行分解。成員企業(yè)按分解的虧損額，在規(guī)定的剩余期限內結轉彌補。
國稅發(fā)[1997]189號文件規(guī)定，經國家稅務總局批準實行由行業(yè)和集團公司匯總、合并繳納企業(yè)所得稅的成員企業(yè)（單位）當年發(fā)生虧損，在匯總、合并納稅時已沖抵了其他成員企業(yè)（單位）的所得額或者并入了母公司的虧損額，發(fā)生虧損的成員企業(yè)（單位）不得用本企業(yè)（單位）以后年度實現的所得彌補。成員企業(yè)（單位）在匯總、合并納稅年度以前發(fā)生的虧損可按稅法規(guī)定，用本企業(yè)（單位）以后年度的所得予以彌補，不得并入母（總）公司的虧損額，也不得沖抵其他成員企業(yè)（單位）的所得額。
4.股權投資虧損彌補
國家稅務總局《關于企業(yè)股權投資業(yè)務若干所得稅問題的通知》（國稅發(fā)[2000]118號）規(guī)定，被投資企業(yè)發(fā)生的經營虧損，由被投資企業(yè)按規(guī)定結轉彌補；投資方企業(yè)不得調減其投資成本，也不得確認投資損失。企業(yè)因收回、轉讓或清算處置股權投資而發(fā)生的股權投資損失，可以在稅前扣除，但每一納稅年度扣除的股權投資損失，不得超過當年實現的股權投資收益和投資轉讓所得，超過部分可無限期向以后納稅年度結轉扣除。