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如果企業(yè)多扣了員工的個稅，需要將多扣的部分退回給員工。具體做法如下：
1. 根據(jù)員工實際的應(yīng)納稅所得額和稅率，重新計算員工的個稅應(yīng)扣金額。
2. 計算員工實際應(yīng)扣個稅金額和企業(yè)實際扣繳個稅金額的差額，這部分差額即為多扣的個稅金額。
3. 將多扣的個稅金額記入企業(yè)的其他應(yīng)付款科目，同時在企業(yè)的財務(wù)報表中披露該項應(yīng)付款。
4. 向員工支付多扣的個稅金額，并在企業(yè)的財務(wù)報表中披露該項支出。

需要注意的是，企業(yè)在處理多扣員工個稅退回時，應(yīng)當遵循相關(guān)稅法規(guī)定，確保合法合規(guī)。同時，企業(yè)應(yīng)當保留好相關(guān)的憑證和記錄，以備稅務(wù)機關(guān)審查。