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根據(jù)《企業(yè)所得稅法》的規(guī)定,在退還稅收時,企業(yè)應付的稅款有可能扣除手續(xù)費,退稅的過程中，除了支付企業(yè)本身的稅款外，還需要支付給各級政府有關(guān)部門的一定手續(xù)費。手續(xù)費如果是收取企業(yè)稅收部分，則需要繳納增值稅，稅率一般為6%。增值稅的征收，不受稅收部分的金額多寡影響，按照6%的比例征收，退稅方也有實際繳納增值稅義務。 增值稅是一種由企業(yè)和機關(guān)事業(yè)單位等按照國家稅收籌劃的政策一次性繳納的稅款，它的本質(zhì)是從營收中抽取企業(yè)利潤的稅款，并且由企業(yè)自行繳納。計算企業(yè)增值稅的基本方法是：將一期應繳納的營業(yè)稅減去一期的銷項稅款后，將剩余的部分乘以稅率所得到的數(shù)額即為該期應繳納的增值稅。 拓展知識：增值稅是最終消費者承擔的稅，因此增值稅又稱為“消費稅”，消費稅對消費者的購買力產(chǎn)生了一定的消減作用，有助于降低過度消費，抑制膨脹。