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根據(jù)《中華人民共和國稅收征收管理法》的有關規(guī)定，當國際貨物代理公司受委托運輸貨物來境內時，所開發(fā)票的稅目應當選擇服務費（含運費和代理費），如果是在免稅發(fā)票的情況下，可以不開此類發(fā)票，但當貨物運輸完畢需要如實說明其所收取的服務費情況。 運輸貨物的過程中，將會產生一系列稅收，其中包括增值稅，消費稅，營業(yè)稅以及小規(guī)模納稅人應納企業(yè)所得稅等，但是每種稅收仍然有自身的免稅政策范圍，因此發(fā)票種類應當根據(jù)實際情況靈活選擇。 在從國外代理運輸貨物的過程中，還有一個重要的環(huán)節(jié)就是運輸環(huán)節(jié)的清關，清關要隨著國家的相關政策法規(guī)變動而進行及時的更新，以確保在清關環(huán)節(jié)正常正確的完成清關過程，從而更好的完成整個運輸過程。