非增值稅專用發(fā)票抵扣憑證是指稅收法律法規(guī)規(guī)定可以據(jù)以抵扣增值稅進項稅金的非增值稅專用發(fā)票，主要有：運輸發(fā)票、農(nóng)副產(chǎn)品收購憑證、海關進口增值稅專用繳款書（海關完稅憑證）和廢舊物資發(fā)票，也叫“四種票”（有些省市將代開的專用發(fā)票歸入“四種票”中）。納稅人在抵扣“四種票”時要注意以下事項。
海關代征增值稅專用繳款書
增值稅一般納稅人取得所有需抵扣增值稅進項稅額的海關進口增值稅專用繳款書（以下簡稱海關完稅憑證），應根據(jù)相關海關完稅憑證逐票填寫海關完稅憑證抵扣清單，在進行增值稅納稅申報時隨同納稅申報表一并報送。
從3月份申報開始，納稅人除報送海關完稅憑證抵扣清單紙質(zhì)資料外，還需同時報送載有海關完稅憑證抵扣清單電子數(shù)據(jù)的軟盤（或其他存儲介質(zhì)）。未單獨報送的，其進項稅額不得抵扣。如果納稅人未按照規(guī)定要求填寫海關完稅憑證抵扣清單或者填寫內(nèi)容不全的，該張憑證不得抵扣進項稅額。
增值稅一般納稅人取得的2004年2月1日以后開具的海關完稅憑證，應當在開具之日起90天后的第一個納稅申報期結束以前向主管稅務機關申報抵扣，逾期不得抵扣進項稅額；增值稅一般納稅人取得的2004年1月31日以前開具的海關完稅憑證，必須在2004年5月申報期前向主管稅務機關申報抵扣，逾期不再予以抵扣。
增值稅一般納稅人當期未取得海關完稅憑證可不向主管稅務機關報送海關完稅憑證抵扣清單。
廢舊物資普通發(fā)票
生產(chǎn)企業(yè)增值稅一般納稅人購入廢舊物資回收經(jīng)營單位銷售的廢舊物資，可按照廢舊物資回收經(jīng)營單位開具的由稅務機關監(jiān)制的普通發(fā)票上注明的金額，按10％計算抵扣進項稅額。
廢舊物資回收經(jīng)營單位不含個體經(jīng)營者及其他個人。
廢舊物資回收經(jīng)營單位（以下簡稱廢舊單位）應將銷售廢舊物資開具的普通發(fā)票逐票填寫廢舊物資發(fā)票開具清單（以下簡稱“廢舊物資開具清單”），在進行增值稅納稅申報時隨同納稅申報表一并報送。
從2004年3月份申報開始，申報時納稅人要報送廢舊物資開具清單紙質(zhì)資料，同時報送載有廢舊物資開具清單電子數(shù)據(jù)的軟盤（或其他存儲介質(zhì)）。
廢舊單位銷售其收購的廢舊物資，開具普通發(fā)票時，應加蓋財務印章和開票人專章，生產(chǎn)企業(yè)增值稅一般納稅人（以下簡稱生產(chǎn)企業(yè)）取得未加蓋“開票人專章”的普通發(fā)票，不得計算抵扣進項稅額。
增值稅一般納稅人（以下簡稱納稅人）取得所有需抵扣增值稅進項稅額的廢舊物資發(fā)票，應根據(jù)相關廢舊物資發(fā)票逐票填寫廢舊物資發(fā)票抵扣清單（以下簡稱“廢舊物資抵扣清單”），在進行增值稅納稅申報時隨同納稅申報表一并報送。
從3月份申報開始，納稅人報送廢舊物資抵扣清單紙質(zhì)資料，同時報送載有廢舊物資抵扣清單電子數(shù)據(jù)的軟盤（或其他存儲介質(zhì)）。未單獨報送廢舊物資抵扣清單紙質(zhì)資料的，其進項稅額不得抵扣。如果納稅人未按照規(guī)定要求填寫廢舊物資抵扣清單的，該張憑證不得抵扣進項稅額。
增值稅一般納稅人取得的2004年3月1日以后開具的廢舊物資發(fā)票，應當在開具之日起90天后的第一個納稅申報期結束以前向主管稅務機關申報抵扣，逾期不得抵扣進項稅額；增值稅一般納稅人取得的2004年3月1日以前開具的廢舊物資發(fā)票，必須在2004年6月申報期前向主管稅務機關申報抵扣，逾期不再予以抵扣。
生產(chǎn)單位取得2004年3月1日前開具的未加蓋“開票人專章”的廢舊物資發(fā)票允許抵扣進項稅額，可暫不填寫廢舊物資抵扣清單《銷貨方納稅人識別號》和《銷貨方納稅人鞴芩拔窕卮搿防浮？
廢舊單位當期未開具廢舊物資發(fā)票，增值稅一般納稅人當期未取得廢舊物資發(fā)票可不向主管稅務機關報送廢舊物資開具清單或廢舊物資抵扣清單。
農(nóng)產(chǎn)品收購發(fā)票
增值稅一般納稅人向小規(guī)模納稅人購買農(nóng)產(chǎn)品，可按照《財政部、國家稅務總局關于提高農(nóng)產(chǎn)品進項稅抵扣率的通知》（財稅［2002］12號）的規(guī)定依13％的抵扣率抵扣進項稅額。
從2002年1月1日起，增值稅一般納稅人購進農(nóng)業(yè)生產(chǎn)者銷售的免稅農(nóng)業(yè)產(chǎn)品的進項稅額扣除率由10％提高到13％。
運費發(fā)票
準予抵扣的貨物運費金額是指在運輸單位開具的貨票上注明的運費、建設基金，不包括隨同運費支付的裝卸費、保險費等其他雜費。
從1998年7月1日起，將增值稅一般納稅人購進或銷售應稅貨物支付的運輸費用的扣除率由10％降低為7％。
納稅人購買或銷售免稅貨物所發(fā)生的運輸費用，不得計算進項稅額抵扣。
納稅人購進、銷售貨物所支付的運輸費用明顯偏高，經(jīng)過審查不合理的，不予抵扣運輸費用。
運輸單位提供運輸勞務自行開具的運輸發(fā)票，運輸單位主管地稅局及省級地稅局委托的代開發(fā)票中介機構為運輸單位和個人代開的運輸發(fā)票準予抵扣。其他單位代運輸單位和個人開具的運輸發(fā)票一律不得抵扣。
納稅人取得所有需計算抵扣增值稅進項稅額的運輸發(fā)票，應根據(jù)相關運輸發(fā)票逐票填寫增值稅運輸發(fā)票抵扣清單，在進行增值稅納稅申報時，除按現(xiàn)行規(guī)定申報報表資料外，還需增加報送增值稅運輸發(fā)票抵扣清單。納稅人除報送清單紙質(zhì)資料外，還需同時報送增值稅運輸發(fā)票抵扣清單的電子信息。未單獨報送增值稅運輸發(fā)票抵扣清單紙質(zhì)資料及電子信息的，其運輸發(fā)票進項稅額不得抵扣。如果納稅人未按規(guī)定要求填寫增值稅運輸發(fā)票抵扣清單或者填寫內(nèi)容不全的，該張運輸發(fā)票不得計算抵扣進項稅額。
納稅人取得的2003年10月31日以后開具的運輸發(fā)票，應當自開票之日起90天內(nèi)向主管國稅局申報抵扣，超過90天的不得予以抵扣。
從2003年12月1日起，國稅局對增值稅一般納稅人申請抵扣的所有運輸發(fā)票與營業(yè)稅納稅人開具的貨物運輸業(yè)發(fā)票進行比對。凡比對不符的，一律不予抵扣。對比對異常情況進行核查，并對違反有關法律法規(guī)開具或取得貨物運輸業(yè)發(fā)票的單位進行處罰。
