《中華人民共和國增值稅暫行條例》（中華人民共和國國務(wù)院令2008年第538號）規(guī)定，“購進或者銷售貨物以及在生產(chǎn)經(jīng)營過程中對所支付運輸費用，按照運輸費用結(jié)算單據(jù)上注明的運輸費用金額和7%的扣除率計算的進項稅額。”運輸發(fā)票是增值稅進項稅的重要抵扣憑證，近年來，由運輸費用引發(fā)偷逃增值稅、企業(yè)所得稅現(xiàn)象也不斷發(fā)生，因此，2010年國家稅務(wù)總局將交通運輸企業(yè)列入了專項檢查的重點。
稅務(wù)部門在檢查中發(fā)現(xiàn)，受票企業(yè)通過接受虛開的運輸發(fā)票騙抵增值稅進項稅款是交通運輸企業(yè)虛構(gòu)運輸業(yè)務(wù)違法開具發(fā)票的主要原因。造成這一現(xiàn)象的發(fā)生，歸結(jié)起來這有兩方面原因。在政策方面，由于運輸企業(yè)開具運輸發(fā)票營業(yè)稅金為3%（不考慮所得稅）而在受票方可按7%抵扣增值稅；體制方面，運輸企業(yè)營業(yè)稅及運輸發(fā)票由地稅部門負責(zé)管理，而可抵扣的進項稅由國稅部門進行管理，這很容易造成同一發(fā)票的管理脫節(jié)，形成管理真空。
基于國家稅收檢查力度的加強，在此，結(jié)合中國稅網(wǎng)日常在線咨詢中，大家比較關(guān)注的熱點和難點問題，筆者總結(jié)了以下四個企業(yè)在使用運輸發(fā)票方面容易出錯和忽視的地方，希望引起受票企業(yè)和運輸企業(yè)的重視。
第一，取得票種及開具內(nèi)容是否合法有效
按規(guī)定自開票納稅人和代開票單位必須按照規(guī)定逐欄、如實填開貨物運輸業(yè)發(fā)票，必須填寫該增值稅一般納稅人的名稱和納稅人識別號。貨運發(fā)票的發(fā)貨人、收貨人、起止地、運輸方式、貨物名稱、數(shù)量單價、運輸金額必須填寫齊全，并與購銷貨發(fā)票所列的有關(guān)內(nèi)容相符，運輸發(fā)票支付貨款單位必須與抵扣憑證的銷貨單位或者提供勞務(wù)單位一致。
《國家稅務(wù)總局關(guān)于公路、內(nèi)河貨物運輸業(yè)統(tǒng)一發(fā)票增值稅抵扣有關(guān)問題的公告》（國家稅務(wù)總局公告[2006]2號）規(guī)定，自2007年1月1日起，增值稅一般納稅人購進或銷售貨物，取得的作為增值稅扣稅憑證的貨運發(fā)票，必須是通過貨運發(fā)票稅控系統(tǒng)開具的新版貨運發(fā)票。納稅人取得的2007年1月1日以后開具的舊版貨運發(fā)票，不再作為增值稅扣稅憑證抵扣進項稅額。
因此，取得運輸發(fā)票單位如相關(guān)信息不符合上述規(guī)定，計算的增值稅進項稅額不能抵扣。
第二，申報抵扣是否符合規(guī)定
運輸發(fā)票申報抵扣應(yīng)關(guān)注《國家稅務(wù)總局關(guān)于調(diào)整增值稅扣稅憑證抵扣期限有關(guān)問題的通知》（國稅函[2009]617號）第一條規(guī)定：增值稅一般納稅人取得2010年1月1日以后開具的增值稅專用發(fā)票、道路內(nèi)河貨物運輸業(yè)統(tǒng)一發(fā)票和機動車銷售統(tǒng)一發(fā)票應(yīng)在開具之日起180日內(nèi)到稅務(wù)機關(guān)辦理認證，并在認證通過的次月申報期內(nèi)，向主管稅務(wù)機關(guān)申報抵扣進項稅額。
第三，申報程序是否符合規(guī)定
增值稅一般納稅人取得的所有需計算抵扣增值稅進項稅額的運輸發(fā)票，應(yīng)根據(jù)相關(guān)運輸發(fā)票逐票填寫并報送《增值稅運輸發(fā)票抵扣清單》（還需同時報送電子信息），必須填寫其中的“取得運輸發(fā)票單位名稱及識別號”欄，否則，所取得的運費發(fā)票不能作為增值稅進項抵扣憑證；未單獨報送《增值稅運輸發(fā)票抵扣清單》紙質(zhì)資料及電子信息的，其運輸發(fā)票進項稅額不得抵扣；未按規(guī)定要求填寫《增值稅運輸發(fā)票抵扣清單》或者填寫內(nèi)容不全的，該張運輸發(fā)票就不能計算抵扣進項稅額。但2007年4月1日起，取得運輸發(fā)票需要通過認證后可以抵扣。
第四，擅自擴大抵扣金額
準(zhǔn)予抵扣進項稅額的運輸費用，是指運輸單位開具的發(fā)票上注明的運費、建設(shè)基金，但不包括隨同運費支付裝御費、保險費等其它雜費。
有些企業(yè)將購進固定資產(chǎn)支付的運費列入進項稅進行抵扣；向非一般納稅人購進貨物，因無法取得增值稅專用發(fā)票抵扣稅款，由購貨方將購物的貨款以運輸發(fā)票充數(shù)，按照7%抵扣進項稅額；購進或者銷售免稅貨物所發(fā)生的運輸費用，作為進項稅額抵扣；購貨單位詳細運輸記錄中的裝卸、吊裝、倉儲、清理等雜費也混入運輸費中。
當(dāng)稅務(wù)機關(guān)質(zhì)疑受票單位運輸業(yè)務(wù)真實性或稅務(wù)檢查機關(guān)發(fā)現(xiàn)開票單位存在虛擬運輸業(yè)務(wù)時，將通過對購貨和運輸單位對應(yīng)的物流、票流、資金流方面進行核查，對企業(yè)的供應(yīng)、財務(wù)部門、運輸部門分別調(diào)查，結(jié)合材料采購、貨物運輸、資金支付以及財務(wù)處理進行多方位查證，加以相互印證。其虛開運輸發(fā)票事實會暴露出來，受到應(yīng)有的處罰。
綜上所述，筆者認為，無論是運輸業(yè)還是取得運輸發(fā)票單位，都應(yīng)提高對稅法的遵從度，充分認識違法成本及不良后果對企業(yè)持續(xù)經(jīng)營產(chǎn)生的重大影響。