現(xiàn)代內部審計的內容主要可分為以財務活動為對象的內部財務審計和以經(jīng)營管理活動為對象的經(jīng)濟效益審計兩大類。但在具體實施審計時，二者又是互相聯(lián)系、交叉、滲透的。內部審計人員正是通過對這兩部分內容的聯(lián)系審計來促進審計工作目標的實現(xiàn)的。一般地，內部審計工作的內容包括以下幾部分。　

　　一、財政、財務收支審計

　　與外部審計相比，內部審計實施的財政財務收支審計僅限于對本部門、本單位及所屬各部門、各單位財政財務收支進行的真實、合法和效益審計。由于各部門、各單位的資金來源狀況及資產(chǎn)、負債管理情況不盡相同，內部審計的重點也各不相同。對有國家財政資金介入的部門、單位，不僅要審查其自身財務狀況，還須重點檢查財政資金的使用渠道和使用方向。

　　1.行政單位的內部財政財務收支審計，重點是各級國家權力機關、行政機關、審判機關、檢察機關、各黨派、社會團體及其在境外的派出機構的行政經(jīng)費、罰沒收入和行政性收費的真實、合法和效益性。

　　2.事業(yè)單位的內部財政財務收支審計，重點是各項事業(yè)經(jīng)費收支的真實、合法和效益性，包括用于科學、教育、文化、衛(wèi)生、廣播影視、地震、體育、民政、外交及農(nóng)業(yè)、工業(yè)、交通、郵電通訊、商業(yè)貿(mào)易、工商行政、商品檢驗等各項事業(yè)發(fā)展的經(jīng)費。這里，既包括財政預算撥款的審查，也包括財政預算外安排的各項資金、事業(yè)周轉金和事業(yè)性收費的審查。

　　3.企業(yè)單位（包括金融企業(yè)）的內部財政財務收支審計，重點是其資產(chǎn)、負債和損益的真實、合法和效益性。審查的主要內容：企業(yè)制定的各項制度是否符合國家有關法律法規(guī)的要求；企業(yè)一定時期內擁有的資產(chǎn)、承擔的債務、經(jīng)營成果及其分配情況的真實、合法性；企業(yè)占有的國有資產(chǎn)的安全、完整和保值增值情況。

　　二、經(jīng)濟效益審計

　　財政財務收支審計是內部審計的基礎，經(jīng)濟效益審計則是內部審計發(fā)展到現(xiàn)階段的特殊內容。而且，隨著市場經(jīng)濟競爭的加劇，質量和效益已成為每個企業(yè)發(fā)展的直接決定力；通過內部審計找出經(jīng)營管理中存在的問題，提出改進措施，以提高經(jīng)濟效益，也成為企業(yè)管理者設置內部審計機構和人員的主要目的。內部審計人員在財務收支審計的基礎上進行效益審計，有許多方便之處：一是熟悉本單位情況，可以有針對性地做深入細致的調查工作；二是有足夠的時間深入生產(chǎn)經(jīng)營的各個環(huán)節(jié)，及時取得有關資料和信息；三是內部審計的相對獨立地位，有利于提供客觀、真實、可靠的信息，更好地為改善本部門或本單位的經(jīng)營管理、提高經(jīng)濟效益服務。

　　1.行政單位內部審計所進行的經(jīng)濟效益審計，是結合行政單位財政財務收支的真實性、合法性審查，通過對行政經(jīng)費使用情況的檢查和分析，促使行政單位節(jié)約開支，提高行政經(jīng)費管理水平，提高行政效能，同時也促進行政單位的廉政建設。

　　2.事業(yè)單位內部審計所進行的經(jīng)濟效益審計，是結合事業(yè)經(jīng)費籌集、管理、分配和使用等財政財務收支活動的真實性、合法性審查，通過對事業(yè)經(jīng)費使用情況的檢查和分析，促進有關事業(yè)單位加強事業(yè)經(jīng)費的管理，提高事業(yè)經(jīng)費的使用效益。

　　3.企業(yè)單位（包括金融企業(yè)）內部審計所進行的經(jīng)濟效益審計，主要從改進生產(chǎn)經(jīng)營和完善內部管理制度兩個方面入手。一方面，內部審計通過對企業(yè)供、產(chǎn)、銷各環(huán)節(jié)，人、財、物各要素的檢查、分析，提出建設性意見，可以幫助本部門、本單位負責人制定改進生產(chǎn)經(jīng)營的措施，提高經(jīng)濟效益；另一方面，內部審計通過評價本部門、本單位的內部控制，發(fā)現(xiàn)管理缺陷，提出管理建議等手段，可以幫助本部門、本單位完善內部管理機制，提高經(jīng)濟效益。

　　三、經(jīng)濟責任審計

　　經(jīng)濟責任審計是指審計人員依法對經(jīng)濟責任人所承擔的經(jīng)濟責任的執(zhí)行情況進行的審查。內部審計人員進行的經(jīng)濟責任審計，是結合日常的財政財務收支審計及經(jīng)濟效益審計進行的，一般側重于經(jīng)營責任目標的審計；并通過審計資料和信息的積累，為離任責任審計服務。內部審計人員在執(zhí)行經(jīng)營責任目標審計時，首先通過分析企業(yè)盈虧指標、國有資產(chǎn)保值增值指標、業(yè)務經(jīng)營指標和企業(yè)職工收入分配指標及各項指標的影響因素，確定審查的重點；然后再抓住幾個關鍵的指標，進行局部審查以便及時找出錯誤所在，糾正偏差，改進提高，最終促進任期經(jīng)營目標的實現(xiàn)。