【問】跨地區(qū)經(jīng)營的總分支機構(gòu)，總機構(gòu)在深圳，有多家分支機構(gòu)在外地，總機構(gòu)與各分支機構(gòu)的企業(yè)所得稅稅率都是不一樣，請問總機構(gòu)在做年度企業(yè)所得稅申報時如何計算總機構(gòu)應(yīng)納稅額?
【答】根據(jù)《關(guān)于跨地區(qū)經(jīng)營匯總納稅企業(yè)所得稅征收管理若干問題的通知》（國稅函[2009]221號）的規(guī)定，預(yù)繳時，總機構(gòu)和分支機構(gòu)處于不同稅率地區(qū)的，先由總機構(gòu)統(tǒng)一計算全部應(yīng)納稅所得額，然后按照國稅發(fā)[2008]28號文件第十九條規(guī)定的比例和第二十三條規(guī)定的三因素及其權(quán)重，計算劃分不同稅率地區(qū)機構(gòu)的應(yīng)納稅所得額，再分別按各自的適用稅率計算應(yīng)納稅額后加總計算出企業(yè)的應(yīng)納所得稅總額。再按照國稅發(fā)[2008]28號文件第十九條規(guī)定的比例和第二十三條規(guī)定的三因素及其權(quán)重，向總機構(gòu)和分支機構(gòu)分攤就地預(yù)繳的企業(yè)所得稅款。
匯繳時，企業(yè)年度應(yīng)納所得稅額應(yīng)按上述方法并采用各分支機構(gòu)匯算清繳所屬年度的三因素計算確定。
除《國務(wù)院關(guān)于實施企業(yè)所得稅過渡優(yōu)惠政策的通知》（國發(fā)[2007]39號）、《財政部 國家稅務(wù)總局關(guān)于企業(yè)所得稅若干優(yōu)惠政策的通知》（財稅[2008]1號）和《財政部 國家稅務(wù)總局關(guān)于貫徹落實國務(wù)院關(guān)于實施企業(yè)所得稅過渡優(yōu)惠政策有關(guān)問題的通知》（財稅[2008]21號）有關(guān)規(guī)定外，跨地區(qū)經(jīng)營匯總納稅企業(yè)不得按照上述總分支機構(gòu)處于不同稅率地區(qū)的計算方法計算并繳納企業(yè)所得稅，應(yīng)按照企業(yè)適用統(tǒng)一的稅率計算并繳納企業(yè)所得稅。
所以，總分機構(gòu)適用不同稅率時，請按文件規(guī)定執(zhí)行。