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是的，公司注銷時有其他應付款，股東可以申請退款，則應當繳納個人所得稅。 根據(jù)《中華人民共和國個人所得稅法》，公司注銷時股東申請退款，應當繳納個人所得稅。其中，退款額是按照收入所得級別繳納稅款，如果退款額超過3500元的，應當按照規(guī)定繳納稅款。 拓展知識： 公司注銷時，有一些特殊情況需要繳納稅款，例如：股東追加投資的，股東增加投資的，股東發(fā)行股票的等，都必須繳納營業(yè)稅。同時，如果注銷公司賬戶的財產(chǎn)轉移給股東，股東應當按照規(guī)定繳納轉讓稅。