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從稅務(wù)角度來看，個(gè)人獨(dú)資企業(yè)法人個(gè)人所得稅在經(jīng)營所得申報(bào)的匯算清繳時(shí)扣除工資本身不是重復(fù)扣除，而是根據(jù)稅務(wù)預(yù)繳和實(shí)際所得的差異來處理的。一般情況下，企業(yè)的匯算清繳會(huì)根據(jù)實(shí)際申報(bào)所得進(jìn)行稅務(wù)繳納，即個(gè)人所得稅按稅率從月應(yīng)繳款里面扣除。如果月應(yīng)繳款大于實(shí)際申報(bào)所得，企業(yè)會(huì)根據(jù)稅務(wù)局指示進(jìn)行稅務(wù)繳納，即法人可以申請?jiān)诰C合申報(bào)時(shí)將多繳稅金退回。 拓展知識：零申報(bào)的法人個(gè)人所得稅有幾個(gè)特點(diǎn)：1、不受扣繳義務(wù)人的限制，法人可以自行決定是否申報(bào)及期限；2、只有在滿足條件的情況下，才能申報(bào)，法人需要向稅務(wù)機(jī)關(guān)提交申報(bào)資料；3、申報(bào)所得若超出最高應(yīng)納稅額，則可申請綜合申報(bào)，進(jìn)行減免處理；4、申報(bào)個(gè)人所得稅時(shí)，法人可以通過減免渠道申請減免，減免金額等政策請參照稅務(wù)機(jī)關(guān)規(guī)定。