（1）丟失“空白發(fā)票”。根據(jù)《中華人民共和國發(fā)票管理辦法實(shí)施細(xì)則》第三十一條規(guī)定處理，使用發(fā)票的單位和個(gè)人應(yīng)當(dāng)妥善保管發(fā)票，發(fā)生發(fā)票丟失情形時(shí)，應(yīng)當(dāng)于發(fā)現(xiàn)丟失當(dāng)日書面報(bào)告稅務(wù)機(jī)關(guān)，并在轄區(qū)內(nèi)地級(jí)市報(bào)刊上登報(bào)聲明作廢。然后填報(bào)《發(fā)票掛失損毀報(bào)告表》，持稅控設(shè)備到國稅主管機(jī)關(guān)或自行辦理電子發(fā)票退回或作廢手續(xù)。

稅務(wù)機(jī)關(guān)對(duì)丟失增值稅專用發(fā)票的納稅人，可以按發(fā)票管理辦法未按照規(guī)定保管發(fā)票的情形，由稅務(wù)機(jī)關(guān)責(zé)令限期改正，可以并處1萬元以下的罰款；情節(jié)嚴(yán)重的，處1萬元以上3萬元以下罰款。。

稅務(wù)機(jī)關(guān)對(duì)丟失空白普通發(fā)票的納稅人，可以按發(fā)票管理辦法第三十六條未按照規(guī)定保管發(fā)票的情形，由稅務(wù)機(jī)關(guān)責(zé)令限期改正，可以并處1萬元以下的罰款。情節(jié)嚴(yán)重的，處1萬元以上3萬元以下罰款。。

（2）丟失“已開具增值稅專用發(fā)票”。根據(jù)《國家稅務(wù)總局關(guān)于簡化增值稅發(fā)票領(lǐng)用和使用程序有關(guān)問題的公告》(國家稅務(wù)總局公告2014年第19號(hào))第三條規(guī)定進(jìn)行處理：

“一般納稅人丟失已開具專用發(fā)票的發(fā)票聯(lián)和抵扣聯(lián)，如果丟失前已認(rèn)證相符的，購買方可憑銷售方提供的相應(yīng)專用發(fā)票記賬聯(lián)復(fù)印件及銷售方主管稅務(wù)機(jī)關(guān)出具的《丟失增值稅專用發(fā)票已報(bào)稅證明單》或《丟失貨物運(yùn)輸業(yè)增值稅專用發(fā)票已報(bào)稅證明單》(附件1、2，以下統(tǒng)稱《證明單》)，作為增值稅進(jìn)項(xiàng)稅額的抵扣憑證；如果丟失前未認(rèn)證的，購買方憑銷售方提供的相應(yīng)專用發(fā)票記賬聯(lián)復(fù)印件進(jìn)行認(rèn)證，認(rèn)證相符的可憑專用發(fā)票記賬聯(lián)復(fù)印件及銷售方主管稅務(wù)機(jī)關(guān)出具的《證明單》，作為增值稅進(jìn)項(xiàng)稅額的抵扣憑證。專用發(fā)票記賬聯(lián)復(fù)印件和《證明單》留存?zhèn)洳椤?

一般納稅人丟失已開具專用發(fā)票的抵扣聯(lián)，如果丟失前已認(rèn)證相符的，可使用專用發(fā)票發(fā)票聯(lián)復(fù)印件留存?zhèn)洳�；如果丟失前未認(rèn)證的，可使用專用發(fā)票發(fā)票聯(lián)認(rèn)證，專用發(fā)票發(fā)票聯(lián)復(fù)印件留存?zhèn)洳椤?

一般納稅人丟失已開具專用發(fā)票的發(fā)票聯(lián)，可將專用發(fā)票抵扣聯(lián)作為記賬憑證，專用發(fā)票抵扣聯(lián)復(fù)印件留存?zhèn)洳椤?rdquo;

（3）丟失“已開具的普通發(fā)票”。

丟失已開具的普通發(fā)票發(fā)票聯(lián)，使用發(fā)票的單位和個(gè)人應(yīng)于發(fā)票丟失當(dāng)日在市州級(jí)以上黨政報(bào)刊雜志上刊登遺失聲明，并向主管稅務(wù)機(jī)關(guān)提交已登報(bào)聲明作廢的證明材料。

受票方需要用存根聯(lián)入賬作為稅前扣除憑證的，必須要取得開票方注明“此件是我單位提供，與原件相符”并加蓋公章的存根聯(lián)復(fù)印件，與發(fā)票丟失登報(bào)聲明一并作為原始憑證。

納稅人丟失普通發(fā)票全部聯(lián)次的，按丟失空白普通發(fā)票處理。