居民企業(yè)在中國境內(nèi)跨地區(qū)（指跨省、自治區(qū)、直轄市和計劃單列市，下同）設(shè)立不具有法人資格分支機構(gòu)的，該居民企業(yè)為匯總納稅企業(yè)，企業(yè)所得稅實行匯總納稅管理，即匯總納稅企業(yè)實行“統(tǒng)一計算、分級管理、就地預(yù)繳、匯總清算、財政調(diào)庫”的企業(yè)所得稅征收管理辦法。具體征管按照國家稅務(wù)總局關(guān)于印發(fā)《跨地區(qū)經(jīng)營匯總納稅企業(yè)所得稅征收管理辦法》的公告（國家稅務(wù)總局公告2012年第57號）有關(guān)規(guī)定執(zhí)行。
居民企業(yè)在中國境內(nèi)沒有跨地區(qū)設(shè)立不具有法人資格分支機構(gòu)，僅在同一省、自治區(qū)、直轄市和計劃單列市內(nèi)設(shè)立不具有法人資格分支機構(gòu)的，其企業(yè)所得稅征收管理辦法，由各省、自治區(qū)、直轄市和計劃單列市國家稅務(wù)局、地方稅務(wù)局參照2012年第57號公告規(guī)定聯(lián)合制定。
一、應(yīng)納稅額的計算需要注意的兩個問題
1、一般計算方式
總機構(gòu)分?jǐn)偠惪?匯總納稅企業(yè)當(dāng)期應(yīng)納所得稅額×50％
所有分支機構(gòu)分?jǐn)偠惪羁傤~=匯總納稅企業(yè)當(dāng)期應(yīng)納所得稅額×50％
某分支機構(gòu)分?jǐn)偠惪?所有分支機構(gòu)分?jǐn)偠惪羁傤~×該分支機構(gòu)分?jǐn)偙壤?
某分支機構(gòu)分?jǐn)偙壤?（該分支機構(gòu)營業(yè)收入／各分支機構(gòu)營業(yè)收入之和）×0.35+（該分支機構(gòu)職工薪酬／各分支機構(gòu)職工薪酬之和）×0.35+（該分支機構(gòu)資產(chǎn)總額／各分支機構(gòu)資產(chǎn)總額之和）×0.30
分支機構(gòu)分?jǐn)偙壤瓷鲜龇椒ㄒ唤?jīng)確定后，當(dāng)年一般不作調(diào)整。
2、特殊情形
比如：總機構(gòu)設(shè)在西部大開發(fā)稅收優(yōu)惠地區(qū)的企業(yè)，僅就設(shè)在優(yōu)惠地區(qū)的總機構(gòu)和分支機構(gòu)（不含優(yōu)惠地區(qū)外設(shè)立的二級分支機構(gòu)在優(yōu)惠地區(qū)內(nèi)設(shè)立的三級以下分支機構(gòu)）的所得確定適用15%優(yōu)惠稅率�？倷C構(gòu)設(shè)在西部大開發(fā)稅收優(yōu)惠地區(qū)外的企業(yè)，其在優(yōu)惠地區(qū)內(nèi)設(shè)立的分支機構(gòu)（不含僅在優(yōu)惠地區(qū)內(nèi)設(shè)立的三級以下分支機構(gòu)），僅就該分支機構(gòu)所得確定適用15％優(yōu)惠稅率。
因此，總分機構(gòu)處于不同稅率地區(qū)的，先由總機構(gòu)統(tǒng)一計算全部應(yīng)納稅所得額，然后按規(guī)定和經(jīng)計算的分?jǐn)偙壤嬎銊澐植煌惵实貐^(qū)機構(gòu)的應(yīng)納稅所得額，再分別按各自的適用稅率計算應(yīng)納稅額后加總計算出匯總納稅企業(yè)的應(yīng)納所得稅總額，最后按規(guī)定和經(jīng)計算的分?jǐn)偙壤�，向總機構(gòu)和分支機構(gòu)分?jǐn)偩偷乩U納的企業(yè)所得稅款。
二、關(guān)于預(yù)繳稅款
匯總納稅企業(yè)應(yīng)根據(jù)當(dāng)期實際利潤額，按照規(guī)定的分?jǐn)偡椒ㄓ嬎憧倷C構(gòu)和分支機構(gòu)的企業(yè)所得稅預(yù)繳額，分別由總機構(gòu)和分支機構(gòu)就地預(yù)繳；在規(guī)定期限內(nèi)按實際利潤額預(yù)繳有困難的，也可以按照上一年度應(yīng)納稅所得額的1/12或1/4，按照規(guī)定的預(yù)繳分?jǐn)偡椒ㄓ嬎憧倷C構(gòu)和分支機構(gòu)的企業(yè)所得稅預(yù)繳額，分別由總機構(gòu)和分支機構(gòu)就地預(yù)繳。預(yù)繳方法一經(jīng)確定，當(dāng)年度不得變更。
需要注意的是建筑公司的項目部納稅問題
依據(jù)《國家稅務(wù)總局關(guān)于跨地區(qū)經(jīng)營建筑企業(yè)所得稅征收管理問題的通知》（國稅函〔2010〕156號）規(guī)定，建筑企業(yè)總機構(gòu)直接管理的跨地區(qū)設(shè)立的項目部，應(yīng)按項目實際經(jīng)營收入的0.2%按月或按季由總機構(gòu)向項目所在地預(yù)分企業(yè)所得稅，并由項目部向所在地主管稅務(wù)機關(guān)預(yù)繳。
建筑企業(yè)所屬二級或二級以下分支機構(gòu)直接管理的項目部（包括與項目部性質(zhì)相同的工程指揮部、合同段等，下同）不就地預(yù)繳企業(yè)所得稅，其經(jīng)營收入、職工工資和資產(chǎn)總額應(yīng)匯總到二級分支機構(gòu)統(tǒng)一核算，由二級分支機構(gòu)按照規(guī)定的辦法預(yù)繳企業(yè)所得稅。
總機構(gòu)既有直接管理的跨地區(qū)項目部，又有跨地區(qū)二級分支機構(gòu)的，先扣除已由項目部預(yù)繳的企業(yè)所得稅后，再按照規(guī)定計算總、分支機構(gòu)應(yīng)繳納的稅款
三、關(guān)于匯算清繳
匯總納稅企業(yè)應(yīng)當(dāng)自年度終了之日起5個月內(nèi)，由總機構(gòu)匯總計算企業(yè)年度應(yīng)納所得稅額，扣除總機構(gòu)和各分支機構(gòu)已預(yù)繳的稅款，計算出應(yīng)繳應(yīng)退稅款，按照規(guī)定的稅款分?jǐn)偡椒ㄓ嬎憧倷C構(gòu)和分支機構(gòu)的企業(yè)所得稅應(yīng)繳應(yīng)退稅款，分別由總機構(gòu)和分支機構(gòu)就地辦理稅款入庫或退庫。
匯總納稅企業(yè)在納稅年度內(nèi)預(yù)繳企業(yè)所得稅稅款少于全年應(yīng)繳企業(yè)所得稅稅款的，應(yīng)在匯算清繳期內(nèi)由總、分機構(gòu)分別結(jié)清應(yīng)繳的企業(yè)所得稅稅款；預(yù)繳稅款超過應(yīng)繳稅款的，主管稅務(wù)機關(guān)應(yīng)及時按有關(guān)規(guī)定分別辦理退稅，或者經(jīng)總、分機構(gòu)同意后分別抵繳其下一年度應(yīng)繳企業(yè)所得稅稅款。
注意：分支機構(gòu)也需要報送企業(yè)所得稅年度納稅申報表，格式參照企業(yè)所得稅月(季)度預(yù)繳納稅申報表。同時需附送《中華人民共和國企業(yè)所得稅匯總納稅分支機構(gòu)分配表》。
| 作者：顧老師（正保會計網(wǎng)校答疑專家）
